Manuale d'uso iMed
Introduzione
1.1. Scopu
U scopu di questu web L'applicazione hè di piglià l'infurmazioni prima è permettenu di manipulà in una manera chì dà risultati utili in a decisione. Questu pò esse di furmà un mudellu cù dati crudi o predichendu u risultatu utilizendu mudelli è analisi.
1.2. Menu di navigazione
U menu di navigazione in a cima di a pagina cuntene tutti i ligami per ghjunghje à induve duvete esse. Sè mai vi persu, pudete sempre cliccà a freccia in daretu per ghjunghje à una pagina familiare, vultà in casa, o truvà a pagina chì cercate in u menù di navigazione.
1.3. Cuntu
Se ùn avete micca digià un contu, duvete registrà per aduprà l'applicazione. Per fà quessa, cliccate nant'à u buttone contu in cima dritta è cliccate nant'à registrà. Dopu inserite u vostru nome d'utilizatore, password è email per procederà.
Sè avete digià un contu, accede cù u vostru nome d'utilizatore è password.
Pagina di casa
Cliccà nantu à l'articuli à a manca di a pagina, una descrizzione di ognunu appariscerà à mezu à a pagina per aiutà à capisce ciò chì ognunu face.
iMedBot
L'applicazione iMedBot presenta una interfaccia chì favurisce l'interazzione faciule d'utilizatori cù l'agenti, chì permette una predizione persunalizata è una furmazione di mudellu. Serve cum'è u primu passu versu a trasfurmazioni di i risultati di a ricerca di l'apprendimentu prufonda in un strumentu in linea, chì hà u putenziale di sparghje ricerche di ricerca supplementari in questu duminiu. U so rispettivu manuale d'utilizatore pò esse truvatu quì.
Analisi di dati
4.1. Ritruvà i Subsets
Questa sezione permette à l'utilizatore edità u so dataset. Pudete sceglie di carricà un novu dataset o di utilizà un esistenti da u menù a tendina.
Una volta u dataset hè stata caricata, pudete sceglie l'azzione chì vulete piglià clicchendu una di l'opzioni in u menù di manca.
4.1.1. Ritruvà i sottumessi basati nantu à i filtri
Questa sezione permette di ottene un subset più chjucu di u dataset originale basatu annantu à i filtri dati. Sceglite i valori chì vulete in u subset è poi sceglite e culonne chì vulete mostrate in u dataset finali.
4.1.2. Ritorna i risultati ordinati
Questu torna u dataset in una forma ordinata. Sceglite a colonna di destinazione, l'ordine di ordinamentu, u numeru di fila per rinvià, è quali colonne per vede in u output finali.
4.1.3. Espandi u Dataset
Questu permette à l'utilizatori di espansione una colonna singulari guardata cum'è dizziunariu in una tavola attuale chì l'utilizatore pò manipulà. Piglia un inseme di dati nidificatu è move ciò chì hè dumandatu da l'utilizatore in a capa più alta. Prima, caricate un dataset chì include una colonna cù un dataset nidificatu. Se una colonna chì hà bisognu di espansione hè rilevata automaticamente, sceglite quale colonna per espansione è quali colonne per estrattà da l'infurmazioni nidificate. Cliccate invià è pudete view a vostra infurmazione cum'è colonne di una tavula invece di dati nidificati.
4.2. Unisce Files
Selezziunate è carichendu parechje datasets clicchendu ctrl (cumandamentu per mac), questu li fusionarà in un dataset più grande chì esse usatu per qualcosa altru.
Basta à selezziunà tutti i datasets è compie l'infurmazioni necessarii. Questu hà da salvà u novu dataset à l'applicazione iMed è hè dopu dispunibule per scaricà.
4.3. Funzioni di trama
Questa sezione permette à l'utilizatore di tracciare u so dataset. Sceglite una di l'opzioni nantu à u menù di u latu di a manca è dopu compie i campi richiesti per ottene a vostra trama. Quì sottu sò i tipi di trame chì pudete fà da i vostri dati:
4.4. Analisi statistica
Questa sezione ci permette di eseguisce teste statistiche nantu à u nostru set di dati. Sceglite una prova per eseguisce da u menu di u latu di a manca è compie i campi per eseguisce e teste. Quì sottu sò i tipi di teste chì sò dispunibili:
ODPAC
5.1. Amparate
Questa pagina include una breve descrizzione di ogni tipu di risorsa dispunibule nantu à sta pagina. Cliccà u buttone à a cima di ogni rùbbrica ligame à una altra pagina chì permette à l'utilizatori di utilizà o amparà più nantu à u tema.
5.1.1. Epistasi
Questa pagina ci permette di utilizà MBS, un algoritmu di ricerca per amparà da e dati. In particulare, ci permette di studià l'epistasi, l'interazzione trà dui o più geni chì affettanu u fenotipu. Questu hè utile à prufessiunalifile malatie in l'aspettu geneticu. I metudi cunvinziunali ùn sò micca adattati per trattà e dati d'alta dimensione truvati in studii d'associazione di genomu (GWAS). L'algoritmu di Ricerca Multiple Beam (MBS) permette di detectà i geni interattivi à un ritmu assai più veloce. Caricate i dati chì vulete utilizà è poi inserite i campi richiesti. Per più infurmazione approfondita, truvate u documentu cumpletu quì.
5.1.2. Fattori di risicu
Questa pagina ci permette di utilizà u pacchettu IGain per amparà l'interazzione trà e dati. Ampara in modu specificu l'interazzione da dati d'alta dimensione utilizendu una ricerca euristica. Stu metudu si basa nantu à u metudu Exhaustive_IGain sviluppatu prima per amparà l'interazzione da dati di dimensioni bassu. Caricate i dati è dopu inserite i campi richiesti. Più infurmazione nantu à i limiti IS è iGain ponu esse truvati quì.
5.1.3. Modelli di Previsione
Questa sezione permette l'usu di mudelli di predizioni digià pre-custruiti nantu à i mudelli di apprendimentu di macchina per accelerà u so usu. Questu permette u so usu senza l'usu di codificazione è l'esperienza previa per predichendu mudelli cù u so propiu dataset. Ci sò numerosi mudelli di predizioni dispunibuli per l'utilizatori cumpresi Logistica, Regressione, Support Vector Machines (SVMs), Decision Trees, è assai altri. A lista completa di i metudi di predizione si trova à u latu drittu di a pagina quì.
5.2. Previsione
Questa sezione permette predizioni da un mudellu spartutu caricatu prima. Prima caricate un mudellu spartutu s'ellu ùn hè micca digià fattu. Allora sceglite u mudellu da aduprà per a prediczione clicchendu u nome di u mudellu. Allora caricate e dati per u mudellu di predizione à utilizà. Questu pò esse fattu manualmente utilizendu a forma in u fondu di a pagina o cù u mudellu dispunibule per scaricà. Se utilizate u mudellu, caricate u dataset file è cliccate invià per riceve a predizione di u mudellu.
5.3. Support à a decisione
U supportu di decisione furnisce classificazione è pò guidà e scelte di trattamentu da l'infurmazioni furnite à u sistema. Hè stata furmata da i dati per ricumandà a prucedura di trattamentu ottimale basatu nantu à e caratteristiche di u paziente. Più infurmazione nantu à i Sistemi di Supportu à a Decisione Clinica (CDSS) ponu esse truvati quì.
A Recomendazione di u Sistema piglia e caratteristiche di u paziente è ricumanda a prucedura di trattamentu è predice a probabilità futura di metastasi di 5 anni. L'Intervenzione di l'Usuariu piglia sia e caratteristiche di u paziente è a prucedura di trattamentu per predichendu a probabilità futura di metastasi di 5 anni basatu nantu à u trattamentu attuale invece di u trattamentu ottimale.
MBIL
U Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) hè un algoritmu chì ampara i fatturi di risichi unichi è interattivi chì anu una influenza diretta nantu à u risultatu di un paziente. Cliccate "vai à MBIL" per esse ridiretti à u Python Package Index (PyPI) per u pacchettu MBIL situatu quì. Più infurmazione nantu à MBIL pò esse truvata à BMC Bioinformatics.
Datasets
Questa sezione permette à l'utilizatore per vede è caricate novi datasets à u web applicazione.
7.1. Vede Tutti i Datasets Disponibile
Per vede tutti i datasets dispunibili, basta à cliccà "Mostra i datasets dispunibili".
7.2. Caricate un Dataset
Per carricà un set di dati, cliccate "Share Your Datasets" è dopu compie l'infurmazioni necessarii cum'è dichjaratu nantu à u webpagina. Prima, caricate u dataset è compie i campi richiesti.
Allora, compie i campi sottu o caricate un testu file cù l'infurmazioni cumpletu. Un exampLe di cumu urganizà l'infurmazioni in modu chì l'applicazione pò capisce hè datu quì sottu.
Mudelli
Questa sezione permette à l'utilizatore per vede mudelli dispunibuli per elli è sparte un mudellu.
8.1. Vede tutti i mudelli dispunibuli
Per vede tutti i mudelli dispunibili, cliccate "Mostra i mudelli dispunibili".
8.2. Condividi un mudellu
Per sparte un mudellu, cliccate nantu à "Share Your Models" è poi caricate un mudellu file addestratu da u tensor flow o PyTorch.
8.2.1. Dataset in relazione
Dopu duvete caricate u dataset cunnessu chì include l'intestazione. A classa / etichetta per u dataset deve esse in l'ultima colonna.
8.2.2. Predittori è infurmazione di Classe
Se u dataset include tutte e funziunalità, a forma di funziunalità pò esse saltata dopu a carica di u dataset. Tuttavia, se ùn sò micca tutti inclusi, sta infurmazione deve esse furnita in a descrizzione file o in a forma di funziunalità. Sceglite l'opzione da u menù drop-down indicà cumu intendete furnisce i predittori è l'infurmazioni di classi.
Sè aduprate l'opzione di descrizzione, pudete sia cumpiendu i campi o caricate un testu file cù l'infurmazioni cumpletu. Un exampLe di cumu urganizà l'infurmazioni hè datu quì sottu.
Documenti / Risorse
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